第一次在西宁做CNV-seq 染色体异常测定(通用版)指南

先看数据——西宁CNV-seq 基因组异常检测的检测方法、报告周期和参考费用一目了然。

这个检测查什么

CNV-seq采用低深度全基因组测序技术，测序深度为1×，以GRCh37/hg19为参考基因组，通过高通量测序平台将样本DNA打断制备文库，比对后分析100kb以上的拷贝数变异（CNV）。覆盖染色体非整倍体（如21、18、13三体及性染色体异常）、微缺失/微重复综合征（如DiGeorge、Williams、Prader-Willi等，分辨率100kb-1Mb），以及流产物分子病因（如15三体占早期自然流产1.68%）。参考UCSC、DGV、OMIM、DECIPHER、PubMed和ISCA数据库判读致病性。局限性：不检测多倍体、单亲二倍体、平衡易位、倒位、100kb以下变异、嵌合体及高GC重复区域。检测周期7-10个工作日，无需细胞培养，速度优于传统核型（2周）。

适用对象

• 复发性流产夫妇，流产后2周内收纳绒毛或流产物，查找染色体病因。
• 孕早期（6-12周）超声异常胎儿，羊水穿刺后确诊微缺失/微重复。
• 儿童不明原因智力发育迟缓，1岁内尽早检测以指导康复训练。
• 多发畸形新生儿，出生后立即采集样本排除染色体大片段异常。
• 高龄孕妇（≥35岁）NIPT高风险后，16-22周产前确诊确认。
• 死胎或胚胎停育患者，清宫术中采集组织，避免母血污染。

如何完成检测

1. 咨询：联系西宁合作单位，确认适用时机（流产后/产前/出生后）。
2. 采样：外周血2mL或流产物绒毛/羊水，24小时内冷藏送检。
3. 样本接收：实验室核对信息，评估质量（DNA≥1μg）。
4. DNA提取：从样本中提取基因组DNA。
5. 文库制备：超声打断DNA并制备测序文库。
6. 高通量测序：1×低深度全基因组测序。
7. 生物信息分析：比对至GRCh37/hg19，参考数据库注释CNV。
8. 报告出具：7-10个工作日内输出，含变异坐标、大小、致病性分类及临床建议。

需要注意的事项

• 流产物需24小时内送检，避免母体血液污染影响检验结果。
• 本检测不筛查多倍体、单亲二倍体、平衡易位等，结果阴性需结合临床。
• 报告周期7-10个工作日，从样本到达实验室算起。
• 变异判读基于当前数据库，未来可能随研究更新。
• 阳性结果建议复核（如核型或CMA），尤其高GC区域假阳性风险。
• 不适用点突变检测，单基因病需另选WES。
• 采样前无需空腹，但需避免溶血。
• 邮寄样本用冰袋冷藏，避免反复冻融。